台湾黑心油风波继续升级，10月13日晚，台湾地区领导人马英九点名批评顶新、正义、强冠等企业，称其为“黑心厂商”，并呼吁民众与政府联手抵制。马英九承诺“要把黑心业者彻底清除、让民众生活恢复正常，不查干净绝不停止”，还表示将成立一个跨部门的食品安全办公室，以改善食品安全管理工作。10月14日凌晨，顶新制油董事长遭声请羁押。
经有关部门统计，截止于10月14日16时，全台湾已有22个县市政府发布通告，要求所属机关和学校停止采购、贩卖顶新及味全的产品，这一抵制活动已蔓延至全台湾。
10月13日晚，针对愈演愈烈的劣质油风波及全民抵制行动，马英九首度召开并主持了高级别的“国安会议”，与会者包括台湾地区副领导人和“内政部”、“外交部”、“财政部”、“法务部”、“经济部”、“卫福部”、“陆委会”、“农委会”、“环保署”等各部委的负责人，以及“调查局”及“警政署”的代表。
会议中，马英九表示黑心厂商让民众对食品安全失去信心，并严重影响台湾的声誉和对外贸易，对黑心厂商一定要查办到底、绝不宽贷。“政府一定要让社会大众感觉到执行公权力的魄力和决心，要把黑心业者彻底清除、让民众生活恢复正常，不查干净绝不停止”。
为提高政府对食品安全问题的应对效率，马英九称将比照灾害防救组织模式，将现有的“行政院”食品安全推动工作小组扩大成“食品安全办公室”，新设的食安办将推动跨部门的食品安全管理工作。
此外，马英九还向在野党喊话，呼吁其与执政党携手，早日完成有关食品安全卫生管理相关法律规定的修订。此前民进党前主席苏贞昌曾痛批顶新“还想用眼泪表演、充满空话的记者会推卸责任”。
顶新制油董事长遭声请羁押，前董事长被限制出境
据台湾媒体报道，彰化地检署侦办顶新黑心油案时，查出顶新疑似从越南进口非食用的饲料油，再制作成食用油出售。调查发现，顶新早在2012年起就从越南进口油品，迄今累计进口量已达3216吨，制成了至少3646吨猪油产品。
10月14日凌晨，顶新制油董事长陈茂嘉遭检方声请羁押。陈茂嘉在13日下午被彰化地检署检察官约谈，经过10余小时的讯问，检方将其移送至彰化地检署进行复讯。后检方以担心“串供灭证”为由向彰化地方法院声请羁押禁见，后者将对此进行裁定。
顶新黑心油事件中，目前已被收押的还有顶新前总经理常梅峰、品管组长蔡俊勇;顶新油脂进口商越南大幸福公司负责人杨振益;久丰油脂邱丽品、永成物料负责人蔡镇州、油商林明忠等人。
顶新集团魏家四兄弟之一的魏应充已于10月9日辞去顶新制油、味全、正义三公司董事长职务。魏应充表示未来愿终生担任食安义工，为打造台湾食安环境贡献一己之力。目前魏应充已被限制出境，如果查出他对黑心油案知情，将可能已诈欺罪被起诉。
