此外，目前的包虫病防治，正面临新的挑战。四川省卫计委疾控处副处长胡平告诉21世纪经济报道记者，目前市（州）间、省（区）间联防联控格局尚未全面形成，畜间包虫病综合防治和草原灭鼠经费不足问题突出，四川藏区基层卫生人员人少质弱问题突出，患者内科用药依从性较差。
对此，他建议国家层面出台《犬只规范管理条例》，进一步加大支持力度，开展草原灭鼠；同时，希望国家层面按照“服务人口、服务半径、服务内容”等综合因素确定人员编制，并参照同类地区落实人员工资福利待遇，并给予专项经费予“立项”攻关新药或剂型优化，以进一步提高患者依从性和药品疗效。
