鱼类发生疾病是病原、养殖环境条件和鱼类自身的免疫机制三方面因素综合作用的结果。因此，对疾病的预防必须从消除病原、改善和优化养殖环境、提高鱼类自身免疫力等多方面着手，采取相应的综合技术措施。
抓好池塘清整消毒鱼种放养前必须清除池塘淤泥和杂草，加固池埂，并充分暴晒，以加速有机物矿化、分解。同时使用药物消毒，以杀灭致病菌和寄生虫卵。鱼种放养前10天~15天，用生石灰75千克/亩~80千克/亩带水彻底清塘。
苗种引进前必须实行检疫，不从疫区引进苗种在鱼种放养时实行严格的鱼体消毒，使鱼种不带有病菌或寄生虫入塘，可用30克/升~50克/升的食盐水或15克/立方米的高锰酸钾等溶液浸浴鱼体，具体浸浴时间视水温高低、药物浓度、鱼种体质而定。放养草鱼鱼种最好进行草鱼“三病”灭活疫苗的腹腔注射或浸浴免疫。定期做好水体消毒，一般可用生石灰、二氧化氯、二溴海因等药物交替使用，做到有病早防、无病早治。
把握发病规律，有的放矢防治鱼病鱼病的发生具有一定规律，一般春季以细菌性鱼病为主，夏季以寄生虫病为主，秋季以暴发性鱼病为主，冬春季又以细菌性鱼病为主。根据鱼病发生季节和病原微生物情况，适时采取抑菌药、杀虫药交替使用。
正确诊断病因，做到对症下药鱼类一旦发病，可通过目检、镜检等方式进行诊断，根据典型症状查找病原，并正确选用药物治疗。若遇细菌性或寄生虫多种病原体混合感染造成的疾病，可交替使用灭菌、杀虫药物兼治，用药顺序一般杀虫药在先，杀菌药在后。
注重生态防病，实行健康养殖鱼病的发生和流行与生态环境密切相关，因而生态防病是鱼病防治的重要组成部分，也是今后的发展方向。适时放养鱼种。鱼种运输最适水温为10℃~15℃，因而鱼种放养以冬季（或春节前后）为宜。此时，鱼种操作、运输较为方便，机械损伤小，鱼体感染患病的机率低，可减少鱼病的发生。实行科学混养。合理混养，稀疏同一水体中容易患病鱼类的密度，同时，混养时各养殖品种所占据的生态位置不同，对减少鱼类疾病的发生具有积极作用。优化养殖环境。鱼类发病的因素是多方面的，既有自身的原因，又有环境的因素，因而改善环境条件是防治鱼病的重要技术措施。首先应改良水质。在养殖过程中，须经常加换新水，以稀释养殖水体中有害代谢物，改善生态环境，增强鱼体抗病力。精养高产池塘宜配备增氧机，随时开机增氧，以防鱼类泛塘。其次应科学饲养，做到合理施肥，科学投喂。根据水质、天气、鱼类活动情况等施用肥料，保持水质肥、活、爽、嫩，投喂优质新鲜饲料，并且坚持定时、定质、定位、定量的“四定”原则。
推广使用中草药和微生态制剂防治鱼病中草药来源广泛，价廉效优，毒副作用小，不易形成药物残留和影响水产品质量，在健康养殖中具有广阔的应用前景，微生态制剂因无残留、无二次污染、不产生抗药性等优点，能有效改善水质，增强鱼体免疫力和减少疾病的产生，在无公害绿色水产养殖生产中有良好的应用效果。
