最后一位感染MERS病毒的患者于11月25日死亡——死因并非MERS，而是同样也会妨碍其清除病毒的恶性淋巴瘤。韩国官方严格遵循世界卫生组织（WHO）的指导方针，在28天——两倍于MERS病毒14天的潜伏期——后宣布MERS疫情正式结束。根据WHO标准，最后一名患者在连续两次病毒检测中被确定为阴性之日起，28天后即可宣布疫情结束。
最后一位MERS感染者是一名35岁的男性，他在5月27日接触另一位MERS患者时已经罹患淋巴瘤。这名患者于6月6日生病，并住进了三星医疗中心，之后于6月7日确诊为MERS阳性。他随后被转院至首尔国立大学医院，在那里继续表现出病毒的迹象直至9月30日和10月1日连续两次测试为阴性。韩国保健福祉部在10月2日发布的一份新闻稿中指出，116天是一个确诊MERS患者保持阳性的最长时间记录。韩国保健福祉部表示：“该患者免疫力低下的状况阻碍了身体摆脱病毒。”
该患者因发烧于10月11日返回医院并被再次确诊为MERS病毒阳性。根据韩国保健福祉部的新闻稿，该国疾病控制与预防中心（KCDC）的专家推断，来自MERS病毒的少量遗传物质曾在患者体内休眠。尽管认为该病毒传播的几率非常小，KCDC还是将患者的61位接触着进行了在家隔离。
在住院期间，该男子对病毒的测试轮流呈阳性和阴性。同时，他的淋巴瘤继续恶化并导致他在11月25日死亡。
韩国的MERS暴发源于该国一名男性在赴中东旅行后将病毒带回了家。在他为发烧而寻求治疗以及在5月20日被确诊为MERS之前，病毒已经在几家不同的医院感染了医护人员和患者。MERS的暴发让韩国保健福祉部措手不及。医院确诊及隔离这些被感染者的进度缓慢。并且保健福祉部在最初追踪接触者和实施隔离的过程中磕磕绊绊。但这些控制工作最终产生了效果。韩国在7月4日后便没有再次出现新确诊的感染病例。韩国总理黄教安于7月28日宣布，MERS疫情“事实上已经结束了”。但此次韩国的MERS疫情已经成为迄今为止中东以外地区暴发的最大一次疫情，共发现186人感染MERS，其中38人死亡，近1.7万人接受隔离。
韩国保健福祉部在声明中还表示，由于目前仍存在新型传染病从境外传入的可能，政府今后将继续做好传染病疫情防控工作。
尽管韩国政府和医疗机构在疫情发展的中后期采取了更有效的防控措施，但疫情已造成重大损失，促使各界反思其教训。韩国媒体分析指出，MERS疫情已成为韩国社会重整防疫体系的重要契机，政府已陆续出台一系列法案和方案，包括公开患者信息、建立医院之间及国家和地方政府间的信息共享系统、设立传染病管理事业支援机构、培养流行病学调查人员等。
韩国医学研究所传染病专家申尚烨表示，这次疫情说明韩国的传染病防控系统仍须加以改进，如韩国保健福祉部和疾控中心应加强相关传染病防控方面的培训、提高流行病学专家的数量和质量、指派高级别的行政官员专门为传染病防控提供必要的行政支持等。（赵熙熙）
