男性不育症的治疗必须根据病因，有的放矢。不育者在查清病因后，应结合自己的经济条件及医生意见，选用适合自己的方法，进行循序渐进的治疗。
1.、改善精子质量、无精子症或畸形精子症的病人。提高精子能量的药物如核苷酸、胰激肽释放酶、锌剂、维生素E、A等，性激素类药物有克罗米酚(CC)、绒毛膜促性腺激素(HCG)、补肾益精的中药或中成药等。
2.、病因治疗。对生殖道感染如性病、前列腺炎、输精管炎、附睾炎等，要及早控制泌尿生殖系统的炎症对治疗和预防不育不孕极为重要。
3.、男性功能障碍如阳萎、早泄、不射精、逆行射精等
4.、手术治疗，包括尿道下裂、包皮过长等。输精管再通吻合术、结核等所致的输精管梗阻，对于难以复通的输精管损伤可行睾丸或附睾取精，分离出精子行卵母细胞内单精子注射(ICSI)-胚胎移植(ET)
5、 辅助生殖技术治疗：
如果经过反复检查、治疗，确认不能生育的夫妇，必须冷静地面对现实，可以考虑做人工授精或试管婴儿。适用于无精子症，少精子症和弱精症患者，人工授精是用人工方法将精液注入女性生殖道，以取代性交途径使妇女妊娠的技术。可用精子库的精子也可用丈夫的精子，人工授精已被确认为一项安全并行之有效的治疗不育症的方法。
