在公众股东的眼中，自阿里巴巴2007年11月挂牌上市，至2月21日其发布私有化公告，在1060个交易日内其平均股价为13.94港元/股，也就是说马云给出的私有化价格较阿里巴巴的平均股价仍低3.3%；而某些在41.84元/股的历史高位杀入阿里巴巴的投资者，其亏损额度最高可达六成以上。
对此，北京大学风险投资研究所研究员马光远(微博)表示，马云白白用了股东5年的无息贷款。也有声音指出，阿里巴巴选择此时退市，就意味着此前高价买入的股东再无翻盘的机会，公司的操作对于中小股东是不负责任的。
不过也有不同的声音，名汇证券及期货副总裁张启源表示，纵观阿里巴巴上市之后的股价表现，该股分别在2008年6月12日至2009年5月22日，以及2011年5月19日至停盘前的期间，股价出现了低于13.5的价格区间。在2008年10月28日，即阿里巴巴股价最低位3.46港币时买入股票的投资者，本次私有化将为其带来前所未有的高回报——265%的账面盈利。而过去一年，该股最低价为6.39港币，如在此低位买入股票的投资者，回报可达53%。
与此同时，近日有阿里巴巴起家时的一位资深员工向媒体透露：“这个价格是经过周密考虑的，考虑了股民和平衡各方面的利益，换其他公司可能会压一个极低的价格来回购。而私有化这个事情，公司内部员工之前一律不知道，据我了解，阿里的计划是3年左右时间做整体上市。”
对于投资者到底是支持还是反对，中投顾问IT行业研究员李方庭指出，来自中小股东的阻力不大，这是由于在当前外贸形势低迷的大环境下，阿里巴巴的B2B业务发展形势并不乐观，小股东退出可以降低风险。且通过私有化，企业未来进行战略决策的过程也更容易达成一致意见。交银国际分析师谷馨瑜也表示：“阿里巴巴私有化的成功可能性还是非常大的，毕竟这个溢价还是超出了不少券商的预计。”
北京润正投资咨询有限公司分析师林碧野也向记者表示，高价买入阿里巴巴的股民，私有化的过程对于他们来讲就意味着必须割肉，而某些钟情于阿里巴巴的小股东，可能也会反对退市，不过这毕竟是少数。一般来讲，海外公司的私有化，到最后一定会有一些反对的声音，等到完全退市后，也会面临一系列的诉讼，不过这些都无关痛痒。私有化的整个过程，都是精心策划好的。
